یک سوم این تالاب در ایران و دو سوم آن در کشور عراق واقع است؛ آتش سوزی یکی از چالشهای این تالاب در زمانی است که حقابه آن تامین نشود. در تابستان سال ۹۷ که خشکسالی شدیدی در خوزستان رخ داد نیز آتشسوزی در بخشهای ایرانی و عراقی تالاب هورالعظیم از تیر تا مهر آن سال ادامه داشت. دود ناشی از این آتش سوزی تا بیش از ۱۰۰ کیلومتر در خوزستان پیش رفت و هشت شهرستان را درگیر کرد. شهریور ۱۴۰۰ نیز آتش سوزی در سه نقطه از بخش عراقی تالاب هورالعظیم، باعث شد دود این آتش سوزی شهر رُفیّع از توابع شهرستان هویزه را فرا گیرد. رودخانه کرخه امسال برای سومین سال متوالی با بحران کم آبی روبرو بوده و در ماههای اخیر بنا بر اعلام وزارت نیرو در چندین نوبت رهاسازی صورت گرفته است. به گفته فعالان محیط زیستی به علت برداشتهای مکرر از بالادست این آب به طور کامل به تالاب نرسیده است.
اما در خصوص وضعیت تالاب هورالعظیم، معاون محیط طبیعی ادارهکل حفاظت محیط زیست خوزستان گفته: تالاب هورالعظیم همچنان در وضعیت عادی قرار ندارد و نیاز است حقابه بیشتری به این تالاب اختصاص داده شود. عادل مولا در مصاحبهای که با ایرنا داشته، به میزان دریافت حقابه تالاب هورالعظیم در سال آبی جاری (مهر ماه ۱۴۰۱تا شهریور ۱۴۰۲) اشاره کرده و افزوده: ۶۷ درصد حقابه تالاب هورالعظیم در سه ماهه دی، بهمن و اسفند۱۴۰۱ دریافت شده است که این میزان حدود ۷۰۰ میلیون متر مکعب میشود.
او با بیان اینکه حقابه تالاب هورالعظیم بیش از یک میلیارد متر مکعب است توضیح داده: در مجموع در سال آبی جاری حدود ۹۳۱ میلیون متر مکعب از حقابه داده شده است و در چند ماه اخیر با توجه به رها شدن موجی آب و برداشتها از بالادست، حقابه تالاب محقق نشده است. معاون محیط طبیعی ادارهکل حفاظت محیط زیست خوزستان با اشاره بالا بودن دما و تبخیر در سطح تالاب و تنش وارد شده به مخزن سه، چهار و پنج تالاب در تابستان امسال گفته: انتظار میرود آورد بیشتری برای تالاب در نظر گرفته شود تا مشکل آن رفع شود.
مولا به آتشسوزی نقطهای در ۴۵۰ هکتار از هورالعظیم عراقی هم اشاره کرده و با اشاره به خشک بودن بخش عراقی تالاب هورالعظیم به عنوان عامل آتشسوزی در تالاب گفته: براساس گزارشهای به دست آمده از کشور عراق و تصاویر ماهوارهای در تابستان امسال حدود ۴۵۰ هکتار از تالاب هورالعظیم در عراق به ویژه در حاشیه رودخانههای منتهی به تالاب که عمدتا نیزارهای هستند دچار آتشسوزی شدهاند که این آتشسوزیها در بخش عراقی به صورت نقطهای است.
او با اشاره به تاثیر آلودگی و دود ناشی از این آتشسوزی در استان خوزستان، ادامه داده است که جدای از تاثیری که آتشسوزی بر افزایش آلایندهها در هوا دارد بر روی تالاب نیز اثرگذار است. آتشسوزیها شاید به صورت مستقیم روی تالاب بخش ایرانی موثر نباشد اما به طور غیر مستقیم زیستگاه را با تنش مواجه میکند که این تنشها ممکن است به تمام مناطق سرایت کند.